生物有機肥是在堆肥的基礎上， 向腐熟物料中添加功能性微生物菌劑進行二次發酵而制成的含有大量功能性微生物的有機肥料。

　　它與其他肥料相比具有培肥土壤、改善產品品質等優勢。

　　與化肥相比：生物有機肥的營養元素更為齊全， 長期使用可有效改良土壤，調控土壤及根際微生態平衡，提高作物抗病蟲能力，提高產品質量。

　　與農家肥相比：生物有機肥的根本優勢在于：生物有機肥中的功能菌對提高土壤肥力、促進作物生長具有特定功效，而農家肥屬自然發酵生成，不具備優勢功能菌的特效。

　　與單純菌肥相比：生物有機肥包含功能菌和有機質，有機質除了能改良土壤，其本身就是功能菌生活的環境，施入土壤后功能菌容易定殖并發揮作用;而單純菌肥只含有功能菌， 且其中的功能菌可能不適合有的土壤環境，如果土壤有機質缺乏可能無法存活或發揮應有作用。另一方面，生物有機肥比生物菌肥價格更為便宜。

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